Uma nova era começa em Super Hero Girls: Colégio Metropolis! Quando Batgirl, Mulher-Maravilha, Supergirl, Lanterna Verde, e Zatanna estão constantemente atrasadas para a aula por causa de sua luta contra o crime, elas são obrigadas a participar de um clube após as aulas durante uma semana... ou então serão suspensas! Mas encontrar um clube não é tão fácil quanto parece, e quando as meninas continuam sendo expulsas dos clubes de que gostam, elas devem pensar alternativas e sair de suas zonas de conforto para evitar a suspensão. Justamente quando elas pensavam que lidar com as identidades secretas e as aulas da escola de super-heroísmo já era desafio o suficiente!